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Database of 1101 domains
Matrix: gonnet
Secondary structure prediction:
Contact Capacity Potentials
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Q_Seq: PerlScript 339 a.a. Protein
20 best hits:
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seq d2tysb_ 6431 409 0.00 -100000.00 364 45
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s_m = 2445 s_ss = 37 s_cc = 210 go = -800 ge = -400
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seq d1eny__ 1485 374 0.00 -100000.00 232 27
s_m = 2575 s_ss = 43 s_cc = 76 go = -800 ge = -440
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MCAQYCISFADVEKAHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGA
                                                            
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s_m = 2252 s_ss = 40 s_cc = 90 go = -700 ge = -310
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s_m = 2475 s_ss = 60 s_cc = 76 go = -700 ge = -580
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s_m = 2549 s_ss = 80 s_cc = 116 go = -800 ge = -710
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seq d1dhpa_ 1329 365 0.00 -100000.00 298 32
s_m = 2161 s_ss = 27 s_cc = 76 go = -700 ge = -320
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s_m = 2676 s_ss = 18 s_cc = 28 go = -1000 ge = -330
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s_m = 2124 s_ss = 29 s_cc = 72 go = -600 ge = -300
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MCAQYCISFADVEKAHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGA
                                                            
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s_m = 2523 s_ss = 48 s_cc = -26 go = -900 ge = -380
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seq d1brwa2 1245 353 0.00 -100000.00 258 10
s_m = 1653 s_ss = 25 s_cc = 186 go = -400 ge = -200
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s_m = 2250 s_ss = -6 s_cc = 116 go = -800 ge = -300
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seq d1gtma1 1193 357 0.00 -100000.00 264 36
s_m = 2265 s_ss = 40 s_cc = 426 go = -1100 ge = -490
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s_m = 2080 s_ss = 73 s_cc = 132 go = -800 ge = -390
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seq d1nal1_ 1166 374 0.00 -100000.00 275 29
s_m = 2228 s_ss = -3 s_cc = 62 go = -800 ge = -410
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seq d2tysa_ 1160 354 0.00 -100000.00 262 22
s_m = 2028 s_ss = -4 s_cc = 36 go = -600 ge = -310
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s_m = 1744 s_ss = 33 s_cc = 18 go = -500 ge = -120
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s_m = 1614 s_ss = 54 s_cc = 138 go = -400 ge = -330
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MCAQYCISFADVEKAHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGA
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seq d1pfka_ 1098 376 0.00 -100000.00 334 48
s_m = 2392 s_ss = 4 s_cc = 62 go = -800 ge = -660
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seq d1bjwa_ 1087 392 0.00 -100000.00 343 33
s_m = 2131 s_ss = 34 s_cc = 360 go = -900 ge = -580
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seq d1bg6_2 1075 344 0.00 -100000.00 136 7
s_m = 1583 s_ss = 19 s_cc = 4 go = -400 ge = -130
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seq d1ceqa1 1073 353 0.00 -100000.00 148 13
s_m = 1168 s_ss = 54 s_cc = 124 go = -200 ge = -140
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seq d1dbqa_ 1067 368 0.00 -100000.00 271 30
s_m = 2070 s_ss = 71 s_cc = 8 go = -800 ge = -320
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............................................................
                                                            

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seq d1pjca1 1060 342 0.00 -100000.00 184 19
s_m = 1581 s_ss = -11 s_cc = 134 go = -400 ge = -270
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MCAQYCISFADVEKAHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGA
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seq d1nhp_1 1058 341 0.00 -100000.00 216 24
s_m = 1724 s_ss = 27 s_cc = -94 go = -400 ge = -260
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MCAQYCISFADVEKAHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGA
                                                            
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seq d1byka_ 1046 358 0.00 -100000.00 251 15
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seq d1bs0a_ 1043 393 0.00 -100000.00 330 17
s_m = 1915 s_ss = 0 s_cc = 196 go = -500 ge = -540
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s_m = 1445 s_ss = 19 s_cc = 212 go = -500 ge = -110
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seq d1efva1 1036 355 0.00 -100000.00 188 13
s_m = 1354 s_ss = 7 s_cc = 272 go = -500 ge = -170
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seq d1trb_1 1028 343 0.00 -100000.00 197 15
s_m = 1623 s_ss = 19 s_cc = 164 go = -600 ge = -230
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seq d7odca2 1027 352 0.00 -100000.00 249 17
s_m = 1558 s_ss = 16 s_cc = 120 go = -500 ge = -220
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s_m = 2052 s_ss = 72 s_cc = 36 go = -700 ge = -460
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seq d1amk__ 992 355 0.00 -100000.00 272 34
s_m = 1829 s_ss = 31 s_cc = 96 go = -700 ge = -380
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s_m = 1612 s_ss = 65 s_cc = -90 go = -500 ge = -210
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seq d1fts_2 984 366 0.00 -100000.00 194 22
s_m = 1913 s_ss = 63 s_cc = 208 go = -900 ge = -390
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seq d1a53__ 983 351 0.00 -100000.00 243 17
s_m = 1734 s_ss = 64 s_cc = 202 go = -800 ge = -300
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seq d1cp2a_ 979 365 0.00 -100000.00 255 24
s_m = 2029 s_ss = 30 s_cc = 114 go = -900 ge = -300
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s_m = 1666 s_ss = 73 s_cc = 98 go = -600 ge = -300
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